Οι πρώτες προσπάθειες για την εισαγωγή του θεσμού έγιναν το 1981 από την Ειδική Επαγγελματική Σχολή Αρχιεπίσκοπος Μακάριος Γ '. Το 1983 έγιναν οι πρώτοι αγώνες, που επαναλήφθηκαν το 1985 από το ΄Ιδρυμα Χρίστου Στέλιου Ιωάννου. Από το 1987 οι αγώνες διοργανώνονται από τους Ειδικούς Ολυμπιακούς Κύπρου με την συμμετοχή 29 Σχολών και Ιδρυμάτων απ΄όλη την Κύπρο: Ειδική Σχολή Ευαγγελισμός, Ειδική Σχολή ΄Αγιος Σπυρίδωνας, Ειδική Σχολή Λευκωσίας, ΄Ιδρυμα Απόστολος Παύλος, ΄Ιδρυμα ΄Αγιος Στέφανος, Στέγη Νέα Ελεούσα, Κέντρο Διαμονής και Απασχόλησης ΄Αγιος Λάζαρος, ΄Ιδρυμα Θεοσκέπαστη, Ειδική Σχολή Απόστολος Λουκάς, Ειδική Σχολή Απόστολος Βαρνάβας, Υπηρεσίες Ψυχικής Υγείας, ΄Ιδρυμα Χρίστου Στέλιου Ιωάννου, ΄Ιδρυμα Μαργαρίτα Λιασίδου, ΄Ιδρυμα Θεοτόκος, Ιδιωτικό Ειδικό Σχολείο New Hope, Αθλητική Ομάδα ΄Ηλιος, ΄Ιδρυμα ΄Ελικας, Ειδικό Σχολείο Παιδικού Αναρρωτηρίου Ερυθρού Σταυρού, Σύνδεσμος Γονέων Ενηλίκων Ατόμων Απόστολος Λουκάς, Στέγη Άγιος Χριστόφορος, Κέντρο Ηλιαχτίδα, Ίδρυμα Σκαπανέας, Κέντρο Έκφρασης και Ανθρώπινης Ανάπτυξης, Ίδρυμα Ατόμων με Ειδικές Ανάγκες Άγιος Στυλιανός, Κέντρο Σπαστικών και Αναπήρων, Ειδική Μονάδα Α’ Δημοτικού Σχολείου Αγίου Δομετίου η Ειδική Μονάδα Β’ Δημοτικού Παλιομετόχου, η Ειδική Μονάδα του Γυμνασίου Κωνσταντινουπόλεως και η Ειδική Μονάδα του Γυμνασίου Κοκκινοτριμιθιάς.

Οι Ειδικοί Ολυμπιακοί Κύπρου έχουν ιδρυθεί το 1986. Είναι μέλος των Special Olympics International και της Κυπριακής Ολυμπιακής Επιτροπής. Είναι αναγνωρισμένοι, από την Κυπριακή Ολυμπιακή Επιτροπή, ως ο αθλητικός φορέας για άτομα με νοητική υστέρηση. Είναι μη κερδοσκοπικού χαρακτήρα και οι δραστηριότητές του διεξάγονται με την εθελοντική προσφορά των μελών του.

Τα έξοδα για την διοργάνωση και τη συμμετοχή των αθλητών στις διάφορες δραστηριότητες, τόσο στην Κύπρο όσο και στο εξωτερικό, καλύπτονται από χορηγίες του Κυπριακό Οργανισμό Αθλητισμού, του Σωματείο Cyprus Police Torch Run και ιδιωτικές εταιρείες και οργανισμούς.

Σήμερα, οι Ειδικοί Ολυμπιακοί Κύπρου έχουν επεκταθεί σε ολόκληρη την Κύπρο. Πάνω από 400 αθλητές με νοητική υστέρηση και έντονα μαθησιακά προβλήματα προπονούνται στον Κλασσικό Αθλητισμό, την Κολύμβηση, την Ποδηλασία, το Ποδόσφαιρο, την Καλαθόσφαιρα, την Ολυμπιακή Γυμναστική, την Ιππασία, το Μπόουλινγκ, το Floor Hockey, τις Χιονοδρομίες και τα αγωνίσματα για σωματικά ανάπηρους ( ΜΑΤΡ ). Πρόσφατα έχει αρχίσει και η ανάπτυξη του ενοποιημένου αθλητισμού με την συμμετοχή ατόμων εκτός Ειδικών Ολυμπιακών στο Ποδόσφαιρο και στην Καλαθόσφαιρα.  

Συμπληρώνοντας 20 χρόνια παρουσίας στην Κύπρο, οι Ειδικοί Ολυμπιακοί Κύπρου, χάρη στις άοκνες προσπάθειες του Διοικητικού Συμβουλίου, στην ευαισθησία της πολιτείας, τις ετήσιες χορηγίες του ΚΟΑ και την συνεχή υποστήριξη των χορηγών και εθελοντών, έχουν πετύχει σημαντικές αλλαγές, τόσο στην ευαισθητοποίηση του κοινωνικού συνόλου, όσο και στην δημιουργία συνθηκών για ίσες ευκαιρίες στην κοινωνία. Οι δε αθλητές μας, έχουν κατορθώσει να μας κάνουν εθνικά υπερήφανους σε όλες τις διοργανώσεις, που έχουν λάβει μέρος, κερδίζοντας ευρωπαϊκές και παγκόσμιες